牙周病的直接的原因是存在于牙龈沟菌感染所引起的。身体防御机能被这些细菌所打败的时候就引起了牙周病。牙周组织发炎后，支撑牙齿的牙周膜和牙槽骨被破坏，牙齿和牙龈的分界线处就产生了病理性的缝隙。
引起牙周病的原因是牙周病原性细菌。牙周病原性细菌是厌氧性的，和引起龋病的细菌不同，存在于牙齿和牙齿之间，牙齿和牙龈的分界线等处。另外，和龋病致病菌相比，此类的细菌生长速度慢也是其特征。
并且，这种类型的细菌还与其他多种类的细菌寄生在一起形成细菌性生物膜。一般称之为菌斑。
引起牙周病的原因是这类的细菌集结生活在一起，单纯用药物无法消灭细菌，这也是牙周病治疗困难的原因所在。另外，牙周病除了这些直接的原因以外，诱发使病情加快的称为危险因素。危险因素主要为生活习惯，吸烟，压力等的环境因子，全身疾病，遗传基因，年龄，性别等因素。
另外，也有与细菌感染无关的咬合外伤。这是由于支撑牙齿的牙周组织收到过大的咬合力所引起的损伤。
像这样由于多重原因引起的牙周病的治疗就非常复杂。
了解牙周病和龋病的致病菌的不同之处。牙周病治疗，龋病预防，根据不同目的使用不同牙刷和护理用品。
防龋对策：餐后尽快清洁牙齿表面。
牙周病对策：1日1次对牙齿和牙龈交界面进行逐一仔细的清洁。
